伊人丁香狠狠色综合久久,日韩欧美精品综合久久,亚洲精品老司机综合影院,成人免费一级在线播放

      科研進(jìn)展

      心理所研發(fā)腦影像多中心大數據去站點(diǎn)效應標準化推薦方案

      發(fā)布時(shí)間:2023-04-28 作者:嚴超贛研究組 王瑀薇、嚴超贛

        腦影像已邁入大數據時(shí)代,這意味著(zhù)需要進(jìn)行多中心腦影像大數據合作研究,而有效地去除站點(diǎn)效應以實(shí)現多中心數據標準化融合,是其中關(guān)鍵一步。近日,中國科學(xué)院行為科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室嚴超贛研究組的研究人員針對靜息態(tài)功能磁共振成像(resting-state functional magnetic resonance imaging, R-fMRI)數據融合的站點(diǎn)效應問(wèn)題,進(jìn)行了全面的評估,并提出了一套有效地去站點(diǎn)效應的標準化推薦方案。

        在多個(gè)數據集中,研究人員對各種R-fMRI指標的去站點(diǎn)效應策略進(jìn)行了全面評估,包括測試殘留站點(diǎn)效應、個(gè)體識別能力、重測信度、統計結果的可重復性,以及站點(diǎn)和性別完全混淆情境下的表現。在個(gè)體識別能力(即在不同站點(diǎn)掃描的R-fMRI數據中,是否能識別出同一受試者)上,研究發(fā)現,雖然大多數方法都減少了站點(diǎn)效應,但是基于子采樣最大平均距離的分布偏移校正算法(Subsampling Maximum-mean-distance based distribution shift correction Algorithm, SMA)和基于參數的未校正的CovBat在個(gè)體識別能力(聚類(lèi)準確性)方面優(yōu)于線(xiàn)性回歸模型、線(xiàn)性混合模型、ComBat系列和不變條件變分自編碼器(ICVAE)。在重測信度方面,SMA和基于參數的校正的CovBat優(yōu)于未校正的ComBat系列和基于參數的未校正的CovBat。同時(shí),SMA在Dice系數和大腦性別差異的可重復性方面優(yōu)于后者。此外,SMA在站點(diǎn)和性別完全混淆情境下能更好地檢測到ALFF的可重復的性別差異。為了優(yōu)化SMA的識別能力、重測信度和穩定性,研究人員設計了實(shí)驗來(lái)確定最佳目標站點(diǎn)特征。他們注意到目標站點(diǎn)的樣本量和分布都很重要,并提出了一種啟發(fā)式公式來(lái)選擇目標站點(diǎn)。

      圖1 研究框架和數據

        (A) 評價(jià)框架。研究者從三個(gè)數據集——TSP-3、CoRR 和 FCP(步驟 1)中提取了五個(gè)廣泛使用的 R-fMRI 指標。然后分別用 11 種方法去除它們的站點(diǎn)效應(步驟 2)。研究者從五個(gè)角度評估這些方法:殘留站點(diǎn)效應(均值、方差和協(xié)方差)、個(gè)體可識別性、重測可靠性、可復制性以及站點(diǎn)和性別完全混淆的極端情況(步驟 3)。 (B) 這項工作中使用的數據集的人口統計信息。這包括數據集和站點(diǎn)名稱(chēng)、年齡分布以及每個(gè)站點(diǎn)的女性和男性數量。 (C) 詳細評估過(guò)程。每個(gè)數據集都對殘留站點(diǎn)效應進(jìn)行檢測。對在三個(gè)站點(diǎn)旅行的 41 名受試者進(jìn)行了個(gè)體層面的鑒定。研究者使用分層聚類(lèi)對 123 張圖像進(jìn)行聚類(lèi),通過(guò)聚類(lèi)正確率評估屬于每個(gè)被試的 3 張圖像在校正后是否可以正確地分組在一起(第一行)。性別(男性與女性)的組水平統計分析:重復掃描 CoRR(重測信度,第二行)和 CoRR 和 FCP(可復制性,第三行)之間的Dice系數,以及站點(diǎn)和性別完全混淆(第四行)

        基于以上研究結果,研究團隊推薦了基于SMA的腦影像多中心大數據去站點(diǎn)效應標準化推薦方案。這項工作還將為繼續改進(jìn)和創(chuàng )新腦影像大數據的標準化方法提供有力支持,有助于進(jìn)一步提高多中心神經(jīng)影像研究的準確性和可靠性。研究團隊已經(jīng)將所有數據開(kāi)源在心理科學(xué)數據銀行,代碼開(kāi)源在github,并將在下一個(gè)版本的DPABI中發(fā)布DPABI Harmonization多中心數據去站點(diǎn)效應模塊,將提供包含SMA、ComBat,CovBat和其他方法的用戶(hù)友好操作平臺,以此推動(dòng)領(lǐng)域對該方法的使用和檢驗。

      圖2 研究主要結果

      (左上角)個(gè)體識別正確率:SMA和ComBat、CovBat方法兩兩進(jìn)行統計檢驗。標紅數字表示SMA校正后的個(gè)體識別正確率顯著(zhù)高于該方法校正后的個(gè)體識別正確率,紫色反之。(右側)性別統計結果的重測信度和可重復性:對SMA和其他方法進(jìn)行統計比較,紅色標注出的方法在量化的評估指標上顯著(zhù)低于SMA,黑色則表示無(wú)統計學(xué)差異。(左下角)性別和站點(diǎn)完全混淆的極端情況:研究者比較了來(lái)自 FCP-Cambridge 的 74 名男性和來(lái)自 FCP-Beijing 的 106 名女性的 ALFF 性別差異,CoRR-SWU站點(diǎn)的重測數據協(xié)助ComBat、CovBat 和 SMA 方法進(jìn)行校正。前兩列對應CoRR-SWU兩次重測數據分別協(xié)助校正后的性別統計差異,第三列是前兩列重疊的結果,將第三列結果與可復制的性別統計差異(右下角,深綠色框)結果進(jìn)行對比。同時(shí)給出了CoRR-SWU兩次重測數據性別差異的可復現結果(左下角,亮綠色框)

        研究團隊表示,隨著(zhù)大數據神經(jīng)影像技術(shù)的飛速發(fā)展,去站點(diǎn)效應標準化方案將在基礎研究和臨床應用研究中發(fā)揮關(guān)鍵作用。該方法能夠提高跨站點(diǎn)神經(jīng)影像數據的整合能力,從而為研究者提供更加豐富和準確的大數據資源。這將有助于揭示大腦功能的更多秘密,為神經(jīng)科學(xué)和心理學(xué)的進(jìn)一步發(fā)展提供有力支持。未來(lái),研究人員將繼續關(guān)注去站點(diǎn)效應標準化方案在其他神經(jīng)影像技術(shù)領(lǐng)域的應用,如結構磁共振成像、彌散張量成像等,并探索其在腦影像大數據深度學(xué)習中的優(yōu)化策略??傊?,心理所研發(fā)的腦影像多中心大數據去站點(diǎn)效應標準化推薦方案為神經(jīng)影像領(lǐng)域帶來(lái)了創(chuàng )新性的解決方案,將為多中心大數據研究提供有力支持,有助于解鎖更多關(guān)于大腦功能和心理學(xué)的奧秘。

        此研究已在線(xiàn)發(fā)表于神經(jīng)影像學(xué)期刊NeuroImage,同時(shí)該工作被2023年國際人腦圖譜學(xué)會(huì )年會(huì )(OHBM)遴選為口頭報告。第一作者是心理所博士生王瑀薇,通訊作者為嚴超贛研究員。

        該項目受到科技創(chuàng )新2030-腦科學(xué)與類(lèi)腦研究重大項目(2021ZD0200600)、國家重點(diǎn)研發(fā)計劃(2017YFC1309902)、國家自然科學(xué)基金(82122035、81671774、81630031)、中國科學(xué)院十三五信息化規劃(XXH13505)、中國科學(xué)院重點(diǎn)研究計劃(ZDBS-SSW-JSC006),北京市科技新星計劃(Z191100001119104),以及中國科學(xué)院心理研究所科學(xué)基金(E2CX4425YZ)的資助。

        論文信息:

        Wang, Y.W., Chen, X., Yan, C.G. (2023). Comprehensive evaluation of harmonization on functional brain imaging for multisite data-fusion. Neuroimage, 120089, doi:10.1016/j.neuroimage.2023.120089.


      附件下載: