心理所發(fā)布腦影像標準化計算平臺DPABI (V2.1)
4月15日,中國科學(xué)院行為科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室嚴超贛研究組發(fā)布腦影像標準化計算平臺DPABI(a toolbox for Data Processing & Analysis for Brain Imaging, V2.1)。闡述DPABI計算平臺工作原理、技術(shù)實(shí)現和實(shí)際應用的論文已于4月13日在Neuroinformatics雜志上在線(xiàn)發(fā)表。
DPABI計算平臺是心理所發(fā)布的國際人腦數據共享計劃(The Human Brain Data Sharing Initiative)中靜息態(tài)腦圖譜項目(The R-fMRI Maps Project,由嚴超贛研究組領(lǐng)銜)的關(guān)鍵組成部分。靜息態(tài)腦圖譜項目旨在建立包含廣泛個(gè)體差異的人群(包括正常人以及各種神經(jīng)心理疾病個(gè)體)的腦自發(fā)活動(dòng)圖譜大數據,增進(jìn)人們對正常人腦工作機制及不同神經(jīng)心理疾病譜系腦功能異常機制的理解。該項目將采用DPABI計算平臺,對公開(kāi)的和用戶(hù)自有的靜息態(tài)功能磁共振數據按照標準流程進(jìn)行處理,將處理后的腦圖譜數據指標與全世界相關(guān)科學(xué)領(lǐng)域的研究者共享,不斷積累腦自發(fā)活動(dòng)圖譜大數據。
DPABI計算平臺整合了靜息態(tài)功能磁共振流水線(xiàn)式數據處理工具DPARSF(Data Processing Assistant for Resting-State fMRI),融入了頭動(dòng)控制、噪聲去除、數據標準化等方面的最新研究進(jìn)展。它強調了重測信度和質(zhì)量控制在腦影像數據處理中的影響,并提供了相應的計算模塊;也為動(dòng)物數據(如大鼠和非人類(lèi)靈長(cháng)類(lèi)動(dòng)物)的靜息態(tài)功能磁共振數據提供了用戶(hù)友好的流水線(xiàn)數據處理工具。此外,該平臺包括任務(wù)數據的預處理、結構形態(tài)學(xué)分析、統計分析和結果呈現等模塊,將減少數據處理的手工操作,縮短處理時(shí)間,降低技術(shù)難度,減小出錯概率,并且使得結果在不同研究之間具有更高的可比性。
我們期待DPABI計算平臺幫助更多研究者將靜息態(tài)功能磁共振技術(shù)應用于他們的基礎和臨床研究工作中。我們也期待它能夠促使更多研究者參與到靜息態(tài)腦圖譜項目這一數據共享計劃中,積累腦自發(fā)活動(dòng)圖譜大數據,從而能夠幫助研究者更好地探索人腦功能與心理行為之間的關(guān)系。
論文信息:
Yan, C.G., Wang, X.D., Zuo, X.N., Zang, Y.F., 2016. DPABI: Data Processing & Analysis for (Resting-State) Brain Imaging. Neuroinformatics. In press. doi: 10.1007/s12021-016-9299-4.附件下載: